隨著現代醫學的不斷發展，醫療服務質量、醫學科研成果的開發和醫院社會效益、經濟效益的提高，在很大程度上都取決于醫療儀器設備的現代化和先進水平。北京佑安醫院醫學工程中心作為醫療儀器設備的管理部門在醫院發展建設過程中的作用日益重要。醫學工程中心的工作職責是對全院醫療儀器設備進行全方位的動態管理，為醫療、科研、教學等工作提供及時優良的技術物資裝備，使醫療、科研、教學活動建立在最佳的醫療儀器設備物質基礎上。醫學工程中心對醫療儀器設備管理的宗旨是利用現代化的管理理論、管理技術和管理方法，以安全有效為起點，以質量管理為核心，與臨床緊密結合，強化技術管理和應用管理于醫療儀器設備全壽命的整個過程，使其達到高效、低耗，發揮最佳效益的總體目標。

醫學工程中心現有醫院正式職工17人，特聘專家1人。